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Biology版 - 到底为什么要做结构?
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话题: 结构话题: 显微镜话题: 生化话题: diffracted话题: first
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1 (共1页)
b******3
发帖数: 377
1
除了可以拿诺贝尔奖,如果不需要结构也能用别的方法知道功能的话?
p****s
发帖数: 3153
2
1. 有意思
2. 说不定能通过结构设计xxx药物
3. 通过结构能够解释机理,就是这功能是怎么实现的,如果以后想改变功能就能有的
放矢
我记得以前上过一门结构课说: function=structure in motion

【在 b******3 的大作中提到】
: 除了可以拿诺贝尔奖,如果不需要结构也能用别的方法知道功能的话?
s******y
发帖数: 28562
3
Structure is like a map to the protein.
Without a map, it would be difficult to understand its function

【在 b******3 的大作中提到】
: 除了可以拿诺贝尔奖,如果不需要结构也能用别的方法知道功能的话?
h****u
发帖数: 480
4

I am not sure that any of these are true. Other than some CNS papers (at
least for now), most structures haven't really contributed to 2) and 3)
because structure = static picture and life is more dynamic.

【在 p****s 的大作中提到】
: 1. 有意思
: 2. 说不定能通过结构设计xxx药物
: 3. 通过结构能够解释机理,就是这功能是怎么实现的,如果以后想改变功能就能有的
: 放矢
: 我记得以前上过一门结构课说: function=structure in motion

T**********t
发帖数: 1604
5
电影不也是一帧帧定格图片串起来的。。。

【在 h****u 的大作中提到】
:
: I am not sure that any of these are true. Other than some CNS papers (at
: least for now), most structures haven't really contributed to 2) and 3)
: because structure = static picture and life is more dynamic.

n***w
发帖数: 2405
6
药化上不是有个术语叫QSAR吗?呵呵。
b******3
发帖数: 377
7
问题就是,说了半天,为什么没有人大张旗鼓的研究到底有没有用?而把这个问题作为
顺理成章的事情。
K**4
发帖数: 1015
8
It is so obvious.

【在 b******3 的大作中提到】
: 问题就是,说了半天,为什么没有人大张旗鼓的研究到底有没有用?而把这个问题作为
: 顺理成章的事情。

a***a
发帖数: 40617
9
因为能发CNS,而且相对来说不需要什么insight和智力,只需要劳动密集苦干就可以了
很符合中国国情

【在 K**4 的大作中提到】
: It is so obvious.
P**l
发帖数: 3722
10
显微镜有什么用

【在 b******3 的大作中提到】
: 除了可以拿诺贝尔奖,如果不需要结构也能用别的方法知道功能的话?
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成熟的红细胞有没有 ribosome 啊?project 请教
计算机模拟蛋白结构?生物学与机器人交叉性研究
11公和BGIRe: Anybody know this about Translation Initiation
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O******e
发帖数: 4845
11
它的作用跟基因测序差不多。这样你总理解它的重要性了吧。

【在 b******3 的大作中提到】
: 问题就是,说了半天,为什么没有人大张旗鼓的研究到底有没有用?而把这个问题作为
: 顺理成章的事情。

z****g
发帖数: 3340
12
要知道功能,有个东东叫生化。还有个东东叫遗传。结构目前作用不太大,除了提供些
details.

【在 b******3 的大作中提到】
: 除了可以拿诺贝尔奖,如果不需要结构也能用别的方法知道功能的话?
z****g
发帖数: 3340
13
要知道功能,有个东东叫生化。还有个东东叫遗传。结构目前作用不太大,除了提供些
details.

【在 b******3 的大作中提到】
: 除了可以拿诺贝尔奖,如果不需要结构也能用别的方法知道功能的话?
p*****m
发帖数: 7030
14
以此类推 显微镜应该也是没用的 反正生化遗传可以解释功能了 lol

【在 z****g 的大作中提到】
: 要知道功能,有个东东叫生化。还有个东东叫遗传。结构目前作用不太大,除了提供些
: details.

w*****r
发帖数: 2061
15
re
结构的paper看起来毫无乐趣

【在 z****g 的大作中提到】
: 要知道功能,有个东东叫生化。还有个东东叫遗传。结构目前作用不太大,除了提供些
: details.

z****g
发帖数: 3340
16
你有可能是做结构的,比较不喜欢我的观点,其实这是结构领域目前的状况。
另外,你类推显微镜更本没道理。

【在 p*****m 的大作中提到】
: 以此类推 显微镜应该也是没用的 反正生化遗传可以解释功能了 lol
p*****m
发帖数: 7030
17
lol 我还真不是做结构的 我就是觉得板上没事就有人出来bash结构毫无道理 也许你们
都比发炸药奖的人更有远见更知道什么是science 我自认为还没那个水平 至于具体结构
解决了什么问题 这个更加不劳我科普 电压敏感的钾通道怎么打开的 光合中心怎么收集
光子的 ATP synthase H0/H1怎么组合起来产生能量的 没有结构你用生化遗传给我分析
分析看?

【在 z****g 的大作中提到】
: 你有可能是做结构的,比较不喜欢我的观点,其实这是结构领域目前的状况。
: 另外,你类推显微镜更本没道理。

C*********u
发帖数: 811
18
好发paper,哈哈

除了可以拿诺贝尔奖,如果不需要结构也能用别的方法知道功能的话?

【在 b******3 的大作中提到】
: 除了可以拿诺贝尔奖,如果不需要结构也能用别的方法知道功能的话?
t**r
发帖数: 93
19
做结构和做microscopy一样都是最直观的方法, 这一点是生化和生理所无法比拟的. 不
过结构本质上和生化一样都是脱离实际的简单重复劳动, 所以它热得快, 很可能也会像
传统生化一样冷得很快. 等目前尚未吃透的重要蛋白都被结构完了, 它的归宿就是JBC
之流的杂志,这一天会很快来的.
w**r
发帖数: 134
20
除了能帮助理解功能,结构的重要性之一体现在药物产业的药物发现和的优化过程中,现在很多药物设计都是基于结构的设计啊,无论是蛋白水解酶抑制剂,kinase inhibitor ,现在有很多成功的基于结构合理设计药物的例子了,著名的像Gleevec,最早基于结构合理设计成功的上市的药物Dorzolamide等等,大家需要多了解下学科的上下游关系,没必要心高气傲和妄自菲薄
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J********n
发帖数: 534
21
seeing is believing
J********n
发帖数: 534
22
其实protein crystallography的原理和显微镜的道理是一模一样的。
"But we can't build an X-ray microscope to look at molecules, for two
reasons. First, we don't have an X-ray lens. Second, even if we did have one
, it would have to be made with tolerances significantly less than the
distance between two atoms! However, we can (in effect) simulate an X-ray
lens on a computer. You can think of a microscope as working in two stages.
First, light strikes the object and is diffracted in various directions. The
lens collects the diffracted rays and reassembles them to form an image.
With X-rays, we can detect diffraction from molecules, but we have to use a
computer to reassemble the image. It's not quite so simple, but that's the
essence of the method."

【在 z****g 的大作中提到】
: 你有可能是做结构的,比较不喜欢我的观点,其实这是结构领域目前的状况。
: 另外,你类推显微镜更本没道理。

g*********r
发帖数: 281
23
Because until you really see it, any biochemistry data could be wrong. For
instance the ion channel gating, there were already tons of biochemistry
data to present multiple mechanisms, but why Nobel price has been given to
Rod.
z****g
发帖数: 3340
24
我说的是结构目前的现状。其实你举的这几个例子,用生化,(电)生理,包括突变,
缺失,阻断剂,协同剂已经提供了
general picture。最后的结构解决了精细的details。但没有dynamic东东。其实关于
结构给出全新的功能, 我倒知道两
个。 一个是Ribosome的ribozyme activity,另一个是Ago2 的RNase H like activity
. 当然这只是极少数的例子而已。
我并不是对结构有偏见,只是说明事实而已。

结构
收集

【在 p*****m 的大作中提到】
: lol 我还真不是做结构的 我就是觉得板上没事就有人出来bash结构毫无道理 也许你们
: 都比发炸药奖的人更有远见更知道什么是science 我自认为还没那个水平 至于具体结构
: 解决了什么问题 这个更加不劳我科普 电压敏感的钾通道怎么打开的 光合中心怎么收集
: 光子的 ATP synthase H0/H1怎么组合起来产生能量的 没有结构你用生化遗传给我分析
: 分析看?

z****g
发帖数: 3340
25
这个比较并不恰当。 显微镜可提供in vivo and real time 的dynamics, 而这是体外
生化不能做倒的。结钩到目前还只能提
供静太东东。

one
.
The
a

【在 J********n 的大作中提到】
: 其实protein crystallography的原理和显微镜的道理是一模一样的。
: "But we can't build an X-ray microscope to look at molecules, for two
: reasons. First, we don't have an X-ray lens. Second, even if we did have one
: , it would have to be made with tolerances significantly less than the
: distance between two atoms! However, we can (in effect) simulate an X-ray
: lens on a computer. You can think of a microscope as working in two stages.
: First, light strikes the object and is diffracted in various directions. The
: lens collects the diffracted rays and reassembles them to form an image.
: With X-rays, we can detect diffraction from molecules, but we have to use a
: computer to reassemble the image. It's not quite so simple, but that's the

p****s
发帖数: 3153
26
I think you are talking about xray, I am not doing that.
Even for Xray, you can still get the structures of different intermediate
states
For dynamics studies, structural methods can do them as well

(at

【在 h****u 的大作中提到】
:
: I am not sure that any of these are true. Other than some CNS papers (at
: least for now), most structures haven't really contributed to 2) and 3)
: because structure = static picture and life is more dynamic.

J********n
发帖数: 534
27
比较下digital camera和camcorder?
另外,还有Time-resolved crystallography

【在 z****g 的大作中提到】
: 这个比较并不恰当。 显微镜可提供in vivo and real time 的dynamics, 而这是体外
: 生化不能做倒的。结钩到目前还只能提
: 供静太东东。
:
: one
: .
: The
: a

w*********e
发帖数: 6093
28
问题是搞显微镜早发不了啥好paper了
s***o
发帖数: 1189
29

赞!

【在 O******e 的大作中提到】
: 它的作用跟基因测序差不多。这样你总理解它的重要性了吧。
n***g
发帖数: 512
30
这个还真不好说,单个蛋白的结构都解出来了,还可以解多个蛋白复合物的结构,蛋白
和化合物的结构等待,基本上是无限多的组合。

JBC

【在 t**r 的大作中提到】
: 做结构和做microscopy一样都是最直观的方法, 这一点是生化和生理所无法比拟的. 不
: 过结构本质上和生化一样都是脱离实际的简单重复劳动, 所以它热得快, 很可能也会像
: 传统生化一样冷得很快. 等目前尚未吃透的重要蛋白都被结构完了, 它的归宿就是JBC
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y*****1
发帖数: 73
31

很多做遗传的也做结构啊
见过几个做mutation 和 DNA repair的都做polymerase什么的结构
话说回来也不知道有什么用

【在 w*****r 的大作中提到】
: re
: 结构的paper看起来毫无乐趣

l*******h
发帖数: 751
32
功能多啦。
可以做药物设计。如果和compound一起结晶可以直接看结合位点。
s********n
发帖数: 2939
33
结构还是非常重要的,尤其是对于rational design方面,如果没有结构基本就是瞎蒙
了。
z****g
发帖数: 3340
34
不知道Time-resolved crystallography 这个东东,不是做结构的,给科普一下。

【在 J********n 的大作中提到】
: 比较下digital camera和camcorder?
: 另外,还有Time-resolved crystallography

1 (共1页)
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