chip seq试验设计 - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - chip seq试验设计

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a*******g 发帖数: 33	1 新手刚接触chip seq, 请教大家一个试验设计问题。试验目的是找出老鼠肺CLUB上皮细胞中某核受体的基因结合位点。因为老板不喜欢细胞系，所以要用primary cell. 从老鼠肺中分离足够多高纯度的club细胞也比较困难。实验室有ccsp cre 该核受体FLOXED老鼠。能否通过比较这种老鼠和 WT老鼠全肺中的chip seq信号来推断该核受体在club细胞中的基因结合位点？谢谢
m******5 发帖数: 1383	2 我觉得如果细胞数量少基本很难。
k*****n 发帖数: 323	3 抗体怎么？大概能搞到多少细胞？
D*a 发帖数: 6830	4 就一个建议，talk to the bioinfo guy!!! 用the的意思是先找到跟你们合作处理数据的实验室和人
m******5 发帖数: 1383	5 我觉得如果细胞少抗体好就往深了测，测个100M 把小peak也statistically饱和了【在 D*a 的大作中提到】 : 就一个建议，talk to the bioinfo guy!!! : 用the的意思是先找到跟你们合作处理数据的实验室和人

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