b******s
发帖数: 1089 | 1 带荧光的细胞，估计最多只能拿到几百个。在国内做RNA-seq，国内小公司要求扩增一
下。
对结果影响大吗？
谢谢！ | O**********a
发帖数: 317 | 2 不就是 SMARTer Kit吗？
能用来测单细胞到一千个细胞。你的情况是测几百个细胞，应该没问题吧。
RNA seq要测至少6个生物学重复。
【在 b******s 的大作中提到】
: 带荧光的细胞，估计最多只能拿到几百个。在国内做RNA-seq，国内小公司要求扩增一
: 下。
: 对结果影响大吗？
: 谢谢！
| b******s
发帖数: 1089 | 3 实际中，大家都是每个样6个生物学重复？
这样做起来好贵啊。
【在 O**********a 的大作中提到】
: 不就是 SMARTer Kit吗？
: 能用来测单细胞到一千个细胞。你的情况是测几百个细胞，应该没问题吧。
: RNA seq要测至少6个生物学重复。
| G******n
发帖数: 289 | 4 6 个sample是统计上结合coverage之后比较好的情况，虽然大家大多数目前还是1个或
者3个……
【在 b******s 的大作中提到】
: 实际中，大家都是每个样6个生物学重复？
: 这样做起来好贵啊。
| k***a
发帖数: 636 | 5 哪里说RNA-seq 要测至少6个生物学重复? reference please
【在 O**********a 的大作中提到】
: 不就是 SMARTer Kit吗？
: 能用来测单细胞到一千个细胞。你的情况是测几百个细胞，应该没问题吧。
: RNA seq要测至少6个生物学重复。
| x***u
发帖数: 297 | 6 RNA-seq differential expression studies: more sequence or more replication?
Yuwen Liu,1,2 Jie Zhou,1,3 and Kevin P. White1,2,3,*
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3904521/ | s******s
发帖数: 13035 | 7 竟然三个作者都认识，汗！
结论是，多replicate比deeper更cost effective,
【在 x***u 的大作中提到】
: RNA-seq differential expression studies: more sequence or more replication?
: Yuwen Liu,1,2 Jie Zhou,1,3 and Kevin P. White1,2,3,*
: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3904521/
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