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Statistics版 - Metropolis Hastings vs. Gibbs sampler。
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一般如何证明MCMC算法得到的sample是来自targeted distribution的呢?付费找tutor
一个关于MCMC 的问题我有几个学位,背景很强,找个intern怎么那么难?
[Need Help] Hierarchical model and MCMC :)Gibbs sampler
向明白Gibbs sampler和stochastic volatility的牛人请教个问题求问一下MCMC和一般的蒙特卡洛法有什么区别?
MCMC不converge怎么办?问个关于hierarchical bayesian model的问题
如何比较两组posterior distribution是否有显著差异问一个sampling from multivariate distribution 的问题
应该怎么准备这MS啊?[合集] 是不是所有的贝叶斯模型都可以用R/SAS写出codes?
请问R里面哪个MCMC(或者metropolis-hastings)的package里的proposal density可以用户定义的MCMC算法的Posterior Std. 一定是减少的么?
相关话题的讨论汇总
话题: gibbs话题: mh话题: sampler话题: sample
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q**j
发帖数: 10612
1
最近在看书。感觉Gibbs sampler简单很多。我在想,如果我们用numerical
integration把那个让积分成为1的常数求出来,就直接用Gibbs sampler好了。MH的优
势在于不需要积分常数。但是好像这个numerical的工作可以“外包”给搞数学的,对
不对?请问这样make sense么,有人这样干过么,效果如何?
l*******r
发帖数: 407
2
你有什么方法来计算多维积分那个标准化常数啊?
b*****n
发帖数: 685
3
两个问题:
1、如果只有一个参数...
2、如果有N多的参数,M-H效率比Gibbs高很多...
a********a
发帖数: 346
4
楼主看的那本书啊?我一直对Gibbs sampling 和MH 感觉心虚。也想学学。谢谢。
q**j
发帖数: 10612
5
你就看chib and greenberg的MH的论文。里面提到一个有关于gibbs sampler的经典论
文。

【在 a********a 的大作中提到】
: 楼主看的那本书啊?我一直对Gibbs sampling 和MH 感觉心虚。也想学学。谢谢。
l******r
发帖数: 18699
6
gibbs sampler能用则用
导不出full conditionals则只能用MH了
MH制造许多rejected samples(无效采样),故效率比较低下

【在 q**j 的大作中提到】
: 最近在看书。感觉Gibbs sampler简单很多。我在想,如果我们用numerical
: integration把那个让积分成为1的常数求出来,就直接用Gibbs sampler好了。MH的优
: 势在于不需要积分常数。但是好像这个numerical的工作可以“外包”给搞数学的,对
: 不对?请问这样make sense么,有人这样干过么,效果如何?

q**j
发帖数: 10612
7
多谢指教。请问MH里面可以想gibbs那样block by block sample,如果我的变量只有10
个。10一起sample,比6-2-2这样sample会差很多么?

【在 l******r 的大作中提到】
: gibbs sampler能用则用
: 导不出full conditionals则只能用MH了
: MH制造许多rejected samples(无效采样),故效率比较低下

l******r
发帖数: 18699
8
其实你可以试试gibbs-in-MH
有时候其中一部分parameter的full conditional是可以导出的,
对于它们,你可以用gibbs sampler
对另一部分导不出来的你可以用MH
可以用所谓的block 技巧,把好几个parameter凑到一块成为一个vector,
然后抽出另一个vector跟原vector做比较看是否reject它
不过这样劣势很大,因为也许其中只有一个parameter应该被rejected,
而其它的都是好sample,
即使如此,也会导致整个vector被rejected,故效率也许比较低下

10

【在 q**j 的大作中提到】
: 多谢指教。请问MH里面可以想gibbs那样block by block sample,如果我的变量只有10
: 个。10一起sample,比6-2-2这样sample会差很多么?

q**j
发帖数: 10612
9
多谢。我是新手。你这个full conditional是指可以完全写出conditional
distribution,包括积分常数,吧?你的意思是如果可以一个一个的用MH,是最有效的
。对不对?找这样看,分成若干个block,比一起sample好。应该是这个道理吧?

【在 l******r 的大作中提到】
: 其实你可以试试gibbs-in-MH
: 有时候其中一部分parameter的full conditional是可以导出的,
: 对于它们,你可以用gibbs sampler
: 对另一部分导不出来的你可以用MH
: 可以用所谓的block 技巧,把好几个parameter凑到一块成为一个vector,
: 然后抽出另一个vector跟原vector做比较看是否reject它
: 不过这样劣势很大,因为也许其中只有一个parameter应该被rejected,
: 而其它的都是好sample,
: 即使如此,也会导致整个vector被rejected,故效率也许比较低下
:

b*****n
发帖数: 685
10
gibbs-in-MH?没听说过哎。
常用的是MH-in-gibbs。

【在 l******r 的大作中提到】
: 其实你可以试试gibbs-in-MH
: 有时候其中一部分parameter的full conditional是可以导出的,
: 对于它们,你可以用gibbs sampler
: 对另一部分导不出来的你可以用MH
: 可以用所谓的block 技巧,把好几个parameter凑到一块成为一个vector,
: 然后抽出另一个vector跟原vector做比较看是否reject它
: 不过这样劣势很大,因为也许其中只有一个parameter应该被rejected,
: 而其它的都是好sample,
: 即使如此,也会导致整个vector被rejected,故效率也许比较低下
:

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l******r
发帖数: 18699
11
gibbs sampler要求我们求出conditional distribution of one parameter given 其
它paramaters,这个conditional distribution叫做full conditional
举个例子,假设你有3个parameters a,b,c
而且你可以精确求出a|b,c和b|a,c的conditional distribution,
则sample a, b时可以用gibbs sampler
可是如果你不能精确求出c|a,b的conditional distribution
则sample c时用MH
gibbs sampler因为是没有 rejective sample,
故block technique在gibbs sampler尤为有用
可是MH经常要reject一些sample,所以block常常不那么容易

【在 q**j 的大作中提到】
: 多谢。我是新手。你这个full conditional是指可以完全写出conditional
: distribution,包括积分常数,吧?你的意思是如果可以一个一个的用MH,是最有效的
: 。对不对?找这样看,分成若干个block,比一起sample好。应该是这个道理吧?

l******r
发帖数: 18699
12
无所谓怎么叫了,反正是二者的结合而已
名字都是人起的:)

【在 b*****n 的大作中提到】
: gibbs-in-MH?没听说过哎。
: 常用的是MH-in-gibbs。

s*******t
发帖数: 45
13
Gibbs 用block的时候,auto correlation会相对影响小一些。
b*****n
发帖数: 685
14
是么?
MH-within-Gibbs是指整个MCMC是Gibbs,不过无法得到conditional posterior
distribution的显式表达所以用MH来获得conditional posterior sample。
Gibbs-within-MH是这意思吗?能否说明白点?

【在 l******r 的大作中提到】
: 无所谓怎么叫了,反正是二者的结合而已
: 名字都是人起的:)

C******n
发帖数: 284
15
正如lookacar所说,这名称真无所谓
如果你一定要纠结,那就如有些人所习惯地称之为hybrid sampling
假如你有多个parameters,其中推倒不出full conditional的就用MH,推得出的就用
Gibbs
update them one by one
that's it
反正我是这样理解的, so far so good

【在 b*****n 的大作中提到】
: 是么?
: MH-within-Gibbs是指整个MCMC是Gibbs,不过无法得到conditional posterior
: distribution的显式表达所以用MH来获得conditional posterior sample。
: Gibbs-within-MH是这意思吗?能否说明白点?

q**j
发帖数: 10612
16
请问一般如何大概估计一下要sample多少次,头多少次的要扔掉?
看了chib and greenberg的文章,我对一次sample所有参数有了感性认识。但是对bloc
k by block update还是有问题。这样做每次的conditional distribution由于conditi
onal on的参数不同,都是应该是不同的函数。怎么肯定会converge呢?一个函数conve
rge还好理解,怎么理解一个family的函数一起converge?
当然我可能是杞人忧天了,应该有大牛做过理论证明的。纯粹是我的心理不好接受。请
问有没有人给个形象的解释或者例子。

【在 C******n 的大作中提到】
: 正如lookacar所说,这名称真无所谓
: 如果你一定要纠结,那就如有些人所习惯地称之为hybrid sampling
: 假如你有多个parameters,其中推倒不出full conditional的就用MH,推得出的就用
: Gibbs
: update them one by one
: that's it
: 反正我是这样理解的, so far so good

q**j
发帖数: 10612
17
对于以下这段话我不太懂。如果分成两组,其中一组接受了;基于这个接受的,再
sample另外一组,被拒绝了。那么就还是生成了一组新observation。对不对。在MH里
面,每次都是能够得到一个新observation的。这个和accept-rejection method还是不
同的。对不对。

【在 l******r 的大作中提到】
: 无所谓怎么叫了,反正是二者的结合而已
: 名字都是人起的:)

b*****n
发帖数: 685
18
呵呵,还是跟我说的一样嘛。
不过很多人做MCMC不严谨,有些人就凭想象乱作一通,根本不管detailed balance。这
个现象很不好。

【在 C******n 的大作中提到】
: 正如lookacar所说,这名称真无所谓
: 如果你一定要纠结,那就如有些人所习惯地称之为hybrid sampling
: 假如你有多个parameters,其中推倒不出full conditional的就用MH,推得出的就用
: Gibbs
: update them one by one
: that's it
: 反正我是这样理解的, so far so good

q**j
发帖数: 10612
19
这个现象可以逐渐改善吧。matlab里面有MH的函数。以后MH和regression一样成了家常
便饭了。

【在 b*****n 的大作中提到】
: 呵呵,还是跟我说的一样嘛。
: 不过很多人做MCMC不严谨,有些人就凭想象乱作一通,根本不管detailed balance。这
: 个现象很不好。

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