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Biology版 - FCM流式细胞实验
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话题: mfi话题: mean话题: 流式细胞话题: intensity
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1 (共1页)
c*******y
发帖数: 1657
1
版上有很熟悉Flow Cytometry流式细胞实验的吗?
用荧光抗体检测细胞表面分子的表达
大家是用什么表征分子表达的多少?是GM值吗?
我做的实验两组对照GM值只有大概1%的差别,但是多次重复实验差别都比较一致
不知道结果可信吗?
w****l
发帖数: 535
2
GM是?定量的话用beads最准,能算出来细胞表面有多少分子

【在 c*******y 的大作中提到】
: 版上有很熟悉Flow Cytometry流式细胞实验的吗?
: 用荧光抗体检测细胞表面分子的表达
: 大家是用什么表征分子表达的多少?是GM值吗?
: 我做的实验两组对照GM值只有大概1%的差别,但是多次重复实验差别都比较一致
: 不知道结果可信吗?

c*******y
发帖数: 1657
3
GM = Geometric Mean
不想精确定量
只是不知道用GM值比较两组对照是否可信?而且两组差值只有5-10%

【在 w****l 的大作中提到】
: GM是?定量的话用beads最准,能算出来细胞表面有多少分子
e*r
发帖数: 103
4
流式能分辨GFP强弱吗?比如溶液里有的细胞带强GFP有的弱。
c*******y
发帖数: 1657
5
GM = Geometric Mean是所有细胞的统计平均值

【在 e*r 的大作中提到】
: 流式能分辨GFP强弱吗?比如溶液里有的细胞带强GFP有的弱。
p****l
发帖数: 291
6
MFI Mean Fluorescence Intensity
you can assess the statistical significance of your data, and caculate P
value

【在 c*******y 的大作中提到】
: 版上有很熟悉Flow Cytometry流式细胞实验的吗?
: 用荧光抗体检测细胞表面分子的表达
: 大家是用什么表征分子表达的多少?是GM值吗?
: 我做的实验两组对照GM值只有大概1%的差别,但是多次重复实验差别都比较一致
: 不知道结果可信吗?

p****l
发帖数: 291
7
MFI Mean Fluorescence Intensity
you should analyze P value between two group of data to know whether there
is statistical significance

【在 c*******y 的大作中提到】
: 版上有很熟悉Flow Cytometry流式细胞实验的吗?
: 用荧光抗体检测细胞表面分子的表达
: 大家是用什么表征分子表达的多少?是GM值吗?
: 我做的实验两组对照GM值只有大概1%的差别,但是多次重复实验差别都比较一致
: 不知道结果可信吗?

p****l
发帖数: 291
8
MFI Mean Fluorescence Intensity
you should caculate P value to know whether here is statistical significance

【在 c*******y 的大作中提到】
: GM = Geometric Mean是所有细胞的统计平均值
e*r
发帖数: 103
9

也就是说高于这个平均值的可能就是强信号?低于的就是弱的?? 如果想要细胞含强
信号的,可以根据这个平均值调节?

【在 c*******y 的大作中提到】
: GM = Geometric Mean是所有细胞的统计平均值
w****l
发帖数: 535
10
统计平均值是怎么算的?
平时我只用MFI

【在 c*******y 的大作中提到】
: GM = Geometric Mean是所有细胞的统计平均值
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c*******y
发帖数: 1657
11
统计平均值就是软件直接给出的MFI
不用自己算

【在 w****l 的大作中提到】
: 统计平均值是怎么算的?
: 平时我只用MFI

c*******y
发帖数: 1657
12
计算出的P值有显著性差异
只是两组差别最多10%

【在 p****l 的大作中提到】
: MFI Mean Fluorescence Intensity
: you should caculate P value to know whether here is statistical significance

c*******y
发帖数: 1657
13
流式细胞测量的是一群细胞的信号,一群细胞内的单个细胞在一定信号范围内有强有弱

【在 e*r 的大作中提到】
:
: 也就是说高于这个平均值的可能就是强信号?低于的就是弱的?? 如果想要细胞含强
: 信号的,可以根据这个平均值调节?

p****l
发帖数: 291
14
10% is 10%, if here is statistical significance, there is difference of the
expression level, although not so strong

【在 c*******y 的大作中提到】
: 计算出的P值有显著性差异
: 只是两组差别最多10%

p****l
发帖数: 291
15
至少每组样品triplicate
然后算表示为mean加减SEM,计算P value
paper上不都是这么show的吗?

【在 w****l 的大作中提到】
: 统计平均值是怎么算的?
: 平时我只用MFI

p****l
发帖数: 291
16


【在 e*r 的大作中提到】
: 流式能分辨GFP强弱吗?比如溶液里有的细胞带强GFP有的弱。
c*******y
发帖数: 1657
17
那我就认定我的结果吧
每次去做流式试验
那个老头跑完样品就说没差别,没有意义
搞的我很心虚

the

【在 p****l 的大作中提到】
: 10% is 10%, if here is statistical significance, there is difference of the
: expression level, although not so strong

c*******y
发帖数: 1657
18
MFI是跑过细胞信号的统计平均值

【在 w****l 的大作中提到】
: 统计平均值是怎么算的?
: 平时我只用MFI

w****l
发帖数: 535
19
这就是Geometry mean? 那不是和arithmetic mean一样么

【在 p****l 的大作中提到】
: 至少每组样品triplicate
: 然后算表示为mean加减SEM,计算P value
: paper上不都是这么show的吗?

w****l
发帖数: 535
20
MFI用geometric mean 不是用arithmetric mean?

【在 c*******y 的大作中提到】
: 统计平均值就是软件直接给出的MFI
: 不用自己算

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w****l
发帖数: 535
21
我一般stimulation和baseline的MFI都是在2倍以上到上百倍的差别
不知道你这个10%差别是比较什么状况

【在 c*******y 的大作中提到】
: 计算出的P值有显著性差异
: 只是两组差别最多10%

c*******y
发帖数: 1657
22
印象中是的

【在 w****l 的大作中提到】
: MFI用geometric mean 不是用arithmetric mean?
c*******y
发帖数: 1657
23
shear & unshear

【在 w****l 的大作中提到】
: 我一般stimulation和baseline的MFI都是在2倍以上到上百倍的差别
: 不知道你这个10%差别是比较什么状况

w****l
发帖数: 535
24
不懂,啥意思

【在 c*******y 的大作中提到】
: shear & unshear
c*******y
发帖数: 1657
25
完全的没意思

【在 w****l 的大作中提到】
: 不懂,啥意思
O******e
发帖数: 4845
26
统计学意义跟生物学意义是两码事。统计学只能给你个参考,告诉你你的实验结果的
可重复性。10%的差别算不算差别,要看你自己领域的常识了。别人发表的文章总会
告诉你这些吧。

【在 c*******y 的大作中提到】
: 那我就认定我的结果吧
: 每次去做流式试验
: 那个老头跑完样品就说没差别,没有意义
: 搞的我很心虚
:
: the

p****l
发帖数: 291
27
http://flowjo.typepad.com/the_daily_dongle/2007/10/mean-median-mod.html
看这个link解释的很清楚

【在 c*******y 的大作中提到】
: 印象中是的
p****l
发帖数: 291
28
你所说的10%的区别应该是两组数据的区别比其中一组数据的MFI mean加减标准差吧
两组MFI之间的差不会是10%的

【在 c*******y 的大作中提到】
: 完全的没意思
p****l
发帖数: 291
29
同意统计学意义和生物学意义是有区别的
但是生物学意义不是正基于统计学的意义吗?
他这个有区别就是有区别,即使区别再微弱,怎么使用和解释数据区别于他要基于这个
数据做什么
如果别人没做过类似的实验比较一个分子在两种细胞的表达情况,那怎么用和解释他就
是第一个了

【在 O******e 的大作中提到】
: 统计学意义跟生物学意义是两码事。统计学只能给你个参考,告诉你你的实验结果的
: 可重复性。10%的差别算不算差别,要看你自己领域的常识了。别人发表的文章总会
: 告诉你这些吧。

c*******y
发帖数: 1657
30
我相信这10%的差别有生物学意义
有文章发表过了
我只是在前人的基础上发展一小步
现在想要探讨机制有点力不从心
可能的假设很多,验证很费时间还不一定成功
而且有的假设也不知道怎么验证
不知道能不能把现有的这一小步弄个小东西出来
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e*r
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31
那能否筛选出不同信号强弱的细胞呢?

【在 c*******y 的大作中提到】
: 流式细胞测量的是一群细胞的信号,一群细胞内的单个细胞在一定信号范围内有强有弱
O******e
发帖数: 4845
32
如果有人对我说,分子Q在两种细胞里面的mRNA表达量相差10%,那么即使这
p=1/100000000000000000,对我来说,基本没有什么生物学意义。

【在 p****l 的大作中提到】
: 同意统计学意义和生物学意义是有区别的
: 但是生物学意义不是正基于统计学的意义吗?
: 他这个有区别就是有区别,即使区别再微弱,怎么使用和解释数据区别于他要基于这个
: 数据做什么
: 如果别人没做过类似的实验比较一个分子在两种细胞的表达情况,那怎么用和解释他就
: 是第一个了

O******e
发帖数: 4845
33
这么小的差别,机制那不是一般化地难做。

【在 c*******y 的大作中提到】
: 我相信这10%的差别有生物学意义
: 有文章发表过了
: 我只是在前人的基础上发展一小步
: 现在想要探讨机制有点力不从心
: 可能的假设很多,验证很费时间还不一定成功
: 而且有的假设也不知道怎么验证
: 不知道能不能把现有的这一小步弄个小东西出来

e*r
发帖数: 103
34
就是只筛信号强的,不筛信号弱的。能做到?

【在 p****l 的大作中提到】
: 能
c*******y
发帖数: 1657
35
流式细胞仪sorting

【在 e*r 的大作中提到】
: 就是只筛信号强的,不筛信号弱的。能做到?
e*r
发帖数: 103
36
Cell sorting可以筛选信号强弱不同的啊???

【在 c*******y 的大作中提到】
: 流式细胞仪sorting
e*r
发帖数: 103
37
有什么文章介绍如何用sorting的吗?
c*******y
发帖数: 1657
38
你最好还是问你们那里专门做FCM的人
能不能做怎样做他们会告诉你的

【在 e*r 的大作中提到】
: 有什么文章介绍如何用sorting的吗?
1 (共1页)
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