菜鸟问一下miRNA和miRNA precursor的sequence问题 - Biology版

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档，一周内的贴子最多显示50字，超过一周显示500字访问原贴

Biology版 - 菜鸟问一下miRNA和miRNA precursor的sequence问题

相关主题
● miRNA名字一问	● 现在哪有比较全的miRNA target database，human的
● microRNA deep sequencing 分析求助	● 哪里可以找到public的next gen seq的data 或者database
● About miRNA' name	● 提交sequence到NCBI database.
● OSU miRNA V3 chip annotation file	● Re: 问题？3'UTR
● 借人气问个miRNA的弱问题啊	● miRNA
● Bioinformatics of HIV immune response Post-doctoral or staff scientist level Columbia University	● 反对中医药的和支持转基因的悲剧了：植物microRNA可以通过食物摄取方式进入人体,通过调控人体内靶基因表达方式影响生理功能
● 哪位朋友可以下载到human mature miRNA全序列的table，谢谢	● miRNA真的可直接将human fibroblast诱导iPS吗？
● 菜鸟请教：P32同位素标记作northern	● Need a paper. Happy new year!

相关话题的讨论汇总
话题: mirna话题: sequence话题: precursor话题: hsa话题: mir

进入Biology版参与讨论

(共1页)

s********e
发帖数: 323

我是学统计的，对miRNA一点也不懂。
我们的数据里有一些miRNA以及sequence信息，都是mature miRNA。然后我们找了个别
人发表的数据，想在里面找和我们的miRNA match的。但是发现别人的数据里都是
precursor，而不是mature miRNA，然后给的sequence和我在网上找到的相应的miRNA
precursor的也不一样。请问如何来判断这些miRNA是不是和我们的一样？仅仅看名字可
靠吗？比如hsa-mir-1-1就一定对应也hsa-mir-1吗？
多谢了！

c*******3
发帖数: 80

你可以上一些miRNA的database比对你的miRNA sequence。比如现今比较常用的miRNA
sequence database有
miRBase：http://www.mirbase.org/ 将你得到的sequence 与其中的进行比对。hsa-mir-1-1 不一定对应 hsa-mir-
1, 因为hsa－mir－1 还包括 hsa－mir－1－2。

【在 s********e 的大作中提到】

: 我是学统计的，对miRNA一点也不懂。
: 我们的数据里有一些miRNA以及sequence信息，都是mature miRNA。然后我们找了个别
: 人发表的数据，想在里面找和我们的miRNA match的。但是发现别人的数据里都是
: precursor，而不是mature miRNA，然后给的sequence和我在网上找到的相应的miRNA
: precursor的也不一样。请问如何来判断这些miRNA是不是和我们的一样？仅仅看名字可
: 靠吗？比如hsa-mir-1-1就一定对应也hsa-mir-1吗？
: 多谢了！

(共1页)

进入Biology版参与讨论

相关主题
● Need a paper. Happy new year!	● 借人气问个miRNA的弱问题啊
● miRNA 过表达问题	● Bioinformatics of HIV immune response Post-doctoral or staff scientist level Columbia University
● 【打人，还是找抽？】：孟山都 vs. 张辰宇(ZZ)	● 哪位朋友可以下载到human mature miRNA全序列的table，谢谢
● 请教: miRNA genome-wide screen　时间和费用	● 菜鸟请教：P32同位素标记作northern
● miRNA名字一问	● 现在哪有比较全的miRNA target database，human的
● microRNA deep sequencing 分析求助	● 哪里可以找到public的next gen seq的data 或者database
● About miRNA' name	● 提交sequence到NCBI database.
● OSU miRNA V3 chip annotation file	● Re: 问题？3'UTR

相关话题的讨论汇总
话题: mirna话题: sequence话题: precursor话题: hsa话题: mir

#	版面	帖数(主题数)
-	全站	4871 (796)
1	Military	3777 (569)
2	Stock	341 (51)
3	Joke	117 (17)
4	History	116 (3)
5	Automobile	100 (9)
6	USANews	55 (9)
7	Midlife	45 (1)
8	Headline	41 (41)
9	Dreamer	33 (13)
10	FleaMarket	32 (20)
11	Living	30 (7)

boards

未名新帖统计// 7月16日

历史上的今天