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Biology版 - 如何区分杂带和不同isoform
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c********r
发帖数: 189
1
在用多抗的时候通常有很多带,如何区分杂带和isoforms呢,或者是蛋白剪切的产物。
多谢
n***w
发帖数: 2405
2
sample + 2nd --> result 1
sample + 1nd + 2nd --> result 2
compare the two?
v***a
发帖数: 1242
3
我一般就是在文献里查,看大概的分子量判断主带。要么就是跑个含量很多的positive
control。

【在 c********r 的大作中提到】
: 在用多抗的时候通常有很多带,如何区分杂带和isoforms呢,或者是蛋白剪切的产物。
: 多谢

m******5
发帖数: 1383
4
Use different antibody as reference

【在 c********r 的大作中提到】
: 在用多抗的时候通常有很多带,如何区分杂带和isoforms呢,或者是蛋白剪切的产物。
: 多谢

s********s
发帖数: 67
5
质谱肯定能解决,就是得花钱。

【在 c********r 的大作中提到】
: 在用多抗的时候通常有很多带,如何区分杂带和isoforms呢,或者是蛋白剪切的产物。
: 多谢

c********r
发帖数: 189
6

这样只能区分出2nd binding的杂带,如果primary也binding呢?

【在 n***w 的大作中提到】
: sample + 2nd --> result 1
: sample + 1nd + 2nd --> result 2
: compare the two?

c********r
发帖数: 189
7

抗体有几个,对老鼠的这个蛋白,都不是很specific,哎

【在 m******5 的大作中提到】
: Use different antibody as reference
c********r
发帖数: 189
8

positive
如果含量很多的话,比如transfected cell,肯定没问题,能检测到。但是如果是检测
endogenous蛋白的话,这个抗体就不好使了

【在 v***a 的大作中提到】
: 我一般就是在文献里查,看大概的分子量判断主带。要么就是跑个含量很多的positive
: control。

c********r
发帖数: 189
9

就算是质谱,如何区分降解蛋白带和不同isoform带呢?

【在 s********s 的大作中提到】
: 质谱肯定能解决,就是得花钱。
v***a
发帖数: 1242
10
是啊,那你可以对照在同一块胶上找到endogenous相应的band,它们应该是在同一水平
线的吧

【在 c********r 的大作中提到】
:
: 就算是质谱,如何区分降解蛋白带和不同isoform带呢?

p********i
发帖数: 116
11
siRNA knock down 之后看看条带,当然首先得确认这个siRNA是有效的。有knockout的
组织更好,但是可能还不如质谱。
c*********r
发帖数: 1312
12
http://www.millipore.com/userguides/tech1/mcproto016
antigen preabsorption.不一定要用链接里说的合成的短肽,如果你的抗原是融合蛋白
的话,用它也可以,总之就是用纯抗原去饱和抗体后做western,看那些条带消失了。
我们自己做的抗体都需要这样验证。

【在 c********r 的大作中提到】
: 在用多抗的时候通常有很多带,如何区分杂带和isoforms呢,或者是蛋白剪切的产物。
: 多谢

m******5
发帖数: 1383
13
你只能区分杂抗体,cross activity 或者moonlit activity还是区分不出来

【在 c*********r 的大作中提到】
: http://www.millipore.com/userguides/tech1/mcproto016
: antigen preabsorption.不一定要用链接里说的合成的短肽,如果你的抗原是融合蛋白
: 的话,用它也可以,总之就是用纯抗原去饱和抗体后做western,看那些条带消失了。
: 我们自己做的抗体都需要这样验证。

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