m******t
发帖数: 109 | 1 最近在作 CHIP SEQ。 INPUT 和 CHIP 的DNA 做LIBRARY 前检查，只有大片断，没有几
百BP的。可在IP前跑的胶上，大部分 是３００－７００BP的。 可能是提纯DNA的过程
中丢失了。 用的是MILLIPORE的CHIP KIT。请教大家的意见。多谢。 |
M********r
发帖数: 142 | |
m******t
发帖数: 109 | |
M********r
发帖数: 142 | 4 那就是DNA提纯失败了。
直接用Qiagen的PCR purification kit就行。
带着beads一起解交联，然后当作普通的PCR产物纯化的步骤。beads堆在column里面没
事的，不影响
【在 m******t 的大作中提到】
: 关键是INPUT的DNA 提纯后也没了
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k*****n
发帖数: 323 | |
j***x
发帖数: 1469 | 6 用glycogen吗？
发现glycogen沉淀的DNA特别粘300-500bp的smear，能跑出2000-3000bp来， 而且会不
会影响后期的建库 ？
【在 k*****n 的大作中提到】
: 酚氯仿抽提后酒精沉淀就好了，别用kit
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k*****n
发帖数: 323 | 7 我没发现影响size的情况，后期qPCR和建文库完全没问题
【在 j***x 的大作中提到】
: 用glycogen吗？
: 发现glycogen沉淀的DNA特别粘300-500bp的smear，能跑出2000-3000bp来， 而且会不
: 会影响后期的建库 ？
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w***r
发帖数: 709 | 8 为啥?
【在 k*****n 的大作中提到】
: 酚氯仿抽提后酒精沉淀就好了，别用kit
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k*****n
发帖数: 323 | 9 这种金贵的实验，我不是很愿意依赖kit。老是觉得万一那个柱子漏了，我就sb了。反
之，自己配的试剂，只要一次work，就说明没问题。而且对我而言，一直work。
【在 w***r 的大作中提到】
: 为啥?
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