t******k
发帖数: 599 | 1 问一个很脑残的问题，如果我有7个样品，4个control和3个ko来作qpcr比较基因a的表
达。我先算每个样品中a相对于reference gene的deltaCt，然后计算出control中a的
deltact平均值和sd，跟ko中a的deltact平均值和sd。根据abi的protocol我可以用
deltact的sd到deltadeltact中，那么最后我计算的power2里面sd怎么算呢？作柱状图
的时候显示的error bar又是啥东西哎？
这个问题想了很久了，看了网上各种材料也没用。如果是开始就control和cko配组的实
验我最后会计算每组power2在一起的sd,可是现在不能配组就不会算了。。。。。 | l********e
发帖数: 415 | 2 这是个好问题,很多人都不知道怎么算.
当然,我也不确定我的算法是不是对的.
参考这里的说明,
http://www.phy.ntnu.edu.tw/demolab/html.php?html=Notes/dataProc
因为Q-PCR的control组和experiment组, 结果的测量方法一样, 所以误差是相关的.
我的算法之一就是两者标准差直接相加.
或者,计算結果的百分误差的平方(等于个別参数的百分误差的平方和),跟第一种算法比
较,取较大的那一个.
插句题外话, 其实统计最重要的还是confidence, 你blind试验能感觉出两组不一样,那
就是不一样.具体怎么算, 都是浮云. | t******k
发帖数: 599 | 3
其实我一般会先用rest 2009那个软件分析一遍数据，然后它会给出有无改变的结论，
只是他家作的box图太丑了，我就想自己做个图，结果发现不会算power2的sd了。。。
。。
【在 l********e 的大作中提到】
: 这是个好问题,很多人都不知道怎么算.
: 当然,我也不确定我的算法是不是对的.
: 参考这里的说明,
: http://www.phy.ntnu.edu.tw/demolab/html.php?html=Notes/dataProc
: 因为Q-PCR的control组和experiment组, 结果的测量方法一样, 所以误差是相关的.
: 我的算法之一就是两者标准差直接相加.
: 或者,计算結果的百分误差的平方(等于个別参数的百分误差的平方和),跟第一种算法比
: 较,取较大的那一个.
: 插句题外话, 其实统计最重要的还是confidence, 你blind试验能感觉出两组不一样,那
: 就是不一样.具体怎么算, 都是浮云.
| c***y
发帖数: 615 | 4 误差传递？？
【在 t******k 的大作中提到】
: 问一个很脑残的问题，如果我有7个样品，4个control和3个ko来作qpcr比较基因a的表
: 达。我先算每个样品中a相对于reference gene的deltaCt，然后计算出control中a的
: deltact平均值和sd，跟ko中a的deltact平均值和sd。根据abi的protocol我可以用
: deltact的sd到deltadeltact中，那么最后我计算的power2里面sd怎么算呢？作柱状图
: 的时候显示的error bar又是啥东西哎？
: 这个问题想了很久了，看了网上各种材料也没用。如果是开始就control和cko配组的实
: 验我最后会计算每组power2在一起的sd,可是现在不能配组就不会算了。。。。。
| M********r
发帖数: 142 | 5 rest2009只能在xp上运行
win7不行
咋整啊
【在 t******k 的大作中提到】
:
: 其实我一般会先用rest 2009那个软件分析一遍数据，然后它会给出有无改变的结论，
: 只是他家作的box图太丑了，我就想自己做个图，结果发现不会算power2的sd了。。。
: 。。
| l**********1
发帖数: 5204 | 6 Pls go to
http://www.researchgate.net/post/Does_anybody_have_rest_2009_so
Bottom Irina Afonina posted stuff if your WIN7 is 64 bit..
【在 M********r 的大作中提到】
: rest2009只能在xp上运行
: win7不行
: 咋整啊
| t******k
发帖数: 599 | |
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