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Biology版 - 为什么我的shRNA knockdown导致靶向基因上调了20倍?
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o**4
发帖数: 35028
1
我用了3个不同位点的shRNA,去做knockdown,
然后用2对不同的引物去检测靶向表达,
得到的结果都是剧烈上调。
怎么解释啊?
O(∩_∩)O谢谢
b******k
发帖数: 1874
2
这是Oct干的吧?呵呵
开玩笑。我听说short RNA 在特定条件下可以稳定靶基因的,比如stress,和Oct也有
关。

【在 o**4 的大作中提到】
: 我用了3个不同位点的shRNA,去做knockdown,
: 然后用2对不同的引物去检测靶向表达,
: 得到的结果都是剧烈上调。
: 怎么解释啊?
: O(∩_∩)O谢谢

o**4
发帖数: 35028
3
真是奇了怪了,有相关文献么?
O(∩_∩)O谢谢

【在 b******k 的大作中提到】
: 这是Oct干的吧?呵呵
: 开玩笑。我听说short RNA 在特定条件下可以稳定靶基因的,比如stress,和Oct也有
: 关。

b******k
发帖数: 1874
4
http://www.sciencemag.org/content/318/5858/1931.abstract

【在 o**4 的大作中提到】
: 真是奇了怪了,有相关文献么?
: O(∩_∩)O谢谢

b******k
发帖数: 1874
5
不过,更有可能只是RNA定量等技术的误差所引起。

【在 o**4 的大作中提到】
: 真是奇了怪了,有相关文献么?
: O(∩_∩)O谢谢

L**********O
发帖数: 1761
6
what is the empty vector you used?
o**4
发帖数: 35028
7
我同时做了很多个knockdown,同时用realtime检测,
只有这个有问题, 技术上应该没有问题

【在 b******k 的大作中提到】
: 不过,更有可能只是RNA定量等技术的误差所引起。
o**4
发帖数: 35028
8
pLKO
luciferase做的对照

【在 L**********O 的大作中提到】
: what is the empty vector you used?
o*****a
发帖数: 2335
9
也许是把那个作用酶饱和了,结果endogenous microRNA发挥不了正常作用,靶基因就
上调了。好像RNAi和microRNA都有这种可能,shRNA不知道。
Z******5
发帖数: 435
10
检测蛋白水平的变化了吗?
o**4
发帖数: 35028
11
没有抗体啊

【在 Z******5 的大作中提到】
: 检测蛋白水平的变化了吗?
o**4
发帖数: 35028
12
不懂

【在 o*****a 的大作中提到】
: 也许是把那个作用酶饱和了,结果endogenous microRNA发挥不了正常作用,靶基因就
: 上调了。好像RNAi和microRNA都有这种可能,shRNA不知道。

o*****a
发帖数: 2335
13
http://www.nature.com/nbt/journal/v27/n6/full/nbt.1543.html

【在 o**4 的大作中提到】
: 不懂
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