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Biology版 - Real time PCR 内参照引物设置 ?
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F***w
发帖数: 58
1
请教:
如果用gene specific primer 做反转录,做real time PCR的时候,怎么设置内参照?
c****1
发帖数: 1095
2
貌似没有办法了,因为你的cDNA里只有你的target。
我没有这样做过,但是你可以试试:在你用gene specific primer 做反转录的时候,
也加入你的内参primer,这样你就引入了内参。
S*****s
发帖数: 287
3
我有点好奇你这个实验设计,为什么要用 GSP 做反转录?和 Oligo dT 相比有什么优
势么?
o*****a
发帖数: 2335
4
比如俺们做microRNA的PCR就是用GSP......

【在 S*****s 的大作中提到】
: 我有点好奇你这个实验设计,为什么要用 GSP 做反转录?和 Oligo dT 相比有什么优
: 势么?

Z******5
发帖数: 435
5
我就这么做的
Transition C19MC microRNAs are processed from introns of large Pol-II, non-
protein-coding transcripts
A Double-Negative Feedback Loop between ZEB1-SIP1 and the microRNA-200
Family Regulates Epithelial-Mesenchymal
参考这两篇文章,可以用第一篇文章中提到的GSP做第二篇文章中的Figure1C
至于要做定量,最好还是用random hexamers做反转录吧。 我试过random hexamers和
OligodT,结果都是一致的。

【在 o*****a 的大作中提到】
: 比如俺们做microRNA的PCR就是用GSP......
S*****s
发帖数: 287
6
优势是什么?我只做过 realtime PCR 不做 microRNA。在我看如果用 oligodT 就可以
拿 GAPDH actin 之类的内参做 control,测出来的 specific level 也更准确一点。

【在 o*****a 的大作中提到】
: 比如俺们做microRNA的PCR就是用GSP......
h****g
发帖数: 439
7
可以再单独逆转录一次,用内对照基因的gene specific primer 或者oligodT。用这个
cDNA 来PCR 内参。
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