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Biology版 - 3包子求助用PCR构建突变体库的问题
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B****w
发帖数: 48
1
RT

我有一个长3KB的转录因子,中间的1000-2000是DNA binding domain。我想对中间
的1000-2000 DNA binding domain用PCR构建突变体库,两端的序列(1-1000和2000-
3000)保持不变。不知道有什么好办法?
谢谢!
m**p
发帖数: 2471
2
最直接的,epPCR

RT我有一个长3KB的转录因子,中间的1000-2000是DNA binding domain。我想对中间的
1000-2000 DNA binding domain用PCR构建........

【在 B****w 的大作中提到】
: RT
:
: 我有一个长3KB的转录因子,中间的1000-2000是DNA binding domain。我想对中间
: 的1000-2000 DNA binding domain用PCR构建突变体库,两端的序列(1-1000和2000-
: 3000)保持不变。不知道有什么好办法?
: 谢谢!

s********n
发帖数: 2939
3
在#1000和#2000左右处引入限制性酶切位点,切掉#1000-2000的片段作为载体,用
epPCR扩增#1000-2000这个片段,酶切后再连上之前的载体就可以了。

【在 B****w 的大作中提到】
: RT
:
: 我有一个长3KB的转录因子,中间的1000-2000是DNA binding domain。我想对中间
: 的1000-2000 DNA binding domain用PCR构建突变体库,两端的序列(1-1000和2000-
: 3000)保持不变。不知道有什么好办法?
: 谢谢!

H*******i
发帖数: 196
4
按照楼上方法
可以用BsaI或者同类酶设计酶切位点,这样对你的基因功能没有影响。
s********n
发帖数: 2939
5
还有一个更简单的方法就是先用epPCR扩增#1000-2000的片段,然后用这个产物作
primer,直接扩增整个质粒,第二步要用高保真的酶,就相当于QuikChange
B****w
发帖数: 48
6
包子已发请查收!
B****w
发帖数: 48
7
刚刚试了一下!好像不行呀!出来的都是Smear.用的酶是phusion, 94度变性,72度退
火延伸。

【在 s********n 的大作中提到】
: 还有一个更简单的方法就是先用epPCR扩增#1000-2000的片段,然后用这个产物作
: primer,直接扩增整个质粒,第二步要用高保真的酶,就相当于QuikChange

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