z********o
发帖数: 137 | 1 博后搞了个新field，虽然比较陌生，但是做着做着觉得做不下去啦！老板很老，以
前80年代90年代早期靠钓新基因发家的，整了一堆蛋白放那里。看看别人有什么新发现
，就拿出来再做一做。我目前做的这个蛋白，在此叫做A，在02年吧，有个牛人在其有
五六十页的专利的一个table里面列出来，说这个蛋白在一类淋巴瘤细胞里面表达量高
，估计跟这类淋巴瘤关系密切。应该是根据microarray得到的data来推论的。但是之后
牛人发了好多paper，关于这类淋巴瘤的，转录因子，蛋白激酶，做了一大堆，也测了
很多microarray 和RNAseq的data，但就是在其文章中找不到关于我做的这个蛋白A的只
言片语。我的老板写的grant，跟这个牛人实验室独立出来的一个老postdoc合写的，里
面有张WT电泳图要显示A在这类淋巴瘤细胞系里，相对与之对应的另外一类淋巴瘤细胞
是高表达的。蛋白A有100kd左右，但是这张WT的图显示的带在35KD左右，他们解释为是
B的特异性降解带。图好像是故意调过的，突出了他们想要表达的意思。我自己专门验
证过，A的蛋白水平并不是在这类淋巴瘤细胞系的每种细胞表达量都高，有的非常低，
而对应的另一类淋巴瘤也不是都低，也有很高的。所以感觉其立题的依据就有问题了。
关于B的文章很少，都不是什么重要的发现，都是些比较小的文章。去年年底在两种细
胞系上knockdown，测microarray，结果very flat，平均每种细胞就只有10来个2 fold
change的基因，GO term什么的都没法做啦！挑了一个比较有意思B的出来，做WT，A
knockdown后B有时能下调很多，有时就下调一点点。今年又做了RNAseq，不知道我怎么
这么倒霉，RNAseq测的质量很好，但是mapping效率太低，结果也是very flat，P
value都非常高，不可信。感觉折腾了这么久，连个direction都没找到。老板又老又穷
又没法沟通，次次talk都要讲3h的废话，经常记错和混淆东西，就拿这次RNAseq的结果
，测成那样了 ，他老还是信心十足，问我不止一次为什么一些fold change大的，为什
么P Value会那么高，他觉得fold change大的，对应的P value应该低才对。我跟他解
释，他也自顾自说，好在这data是找别人分析的。跟帮我分析data的韩国GG聊，他说不
光测序很要运气，就是做转录因子也很要运气，他在yeast里做了36个transcriptional
factor，就只有两三个可以测到比较好的RNAseq和chip-seq data.我下步可能会做
chip-seq。但是我现在怕了都，对这种测序的玩意儿。我就不晓得，我的microarray和
RNAseq是我运气不好测的不好，还是本来我这个蛋白A在这类淋巴瘤里面没什么重要的
作用，而测出来的结果都很flat。大家怎么看呢？什么意见？现在每天都是想逃离的状
态，一到lab就想逃，但是ID在这读书，也是因为ID来这里的，也没法逃。所以每天都
在坚持，一边感觉做不下没去没希望浪费时间，一边感觉自己还没有足够work hard在
良心上谴责自己，同时忍受时不时lab快要倒闭关门的风声，经常要被lab里过期的酶啊
，老印大妈给错细胞细菌啊，买东西被老印大叔盘问，lab发的文章中用的shRNA实际不
怎么work啊之类的乱七八糟的事情刺激。不晓得怎么这么悲催！当初心急，没再等等，
多找几个，也被人忽悠说老板人很nice之类的，就带着一点不情愿来到这个坑里了。真
是被坑惨了呀！
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d***y
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b***k
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f****b
发帖数: 2410 | 4 Title: 被坑惨了，看看我这还做得下去吗？(2.6k) 2/5639
生物人众多啊，只一天时间，or ２４小时把，点击数 5639， |
p**o
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z********o
发帖数: 137 | 6 博后搞了个新field，虽然比较陌生，但是做着做着觉得做不下去啦！
老板很老，以前80年代90年代早期靠钓新基因发家的，整了一堆蛋白放那里
。看看别人有什么新发现，就拿出来再做一做。我目前做的这个蛋白，在此叫做A. 在
02年,有个牛人在其有五六十页的专利的一个table里面列出来，说这个蛋白在一类淋巴
瘤细胞里面表达量高，估计跟这类淋巴瘤关系密切。应该是根据microarray得到的data
来推论的。但是之后牛人发了好多paper，关于这类淋巴瘤的，转录因子，蛋白激酶，
做了一大堆，也测了很多microarray 和RNAseq的data，但就是在其文章中找不到关于
我做的这个蛋白A的只言片语。我的老板写的grant，跟这个牛人实验室独立出来的一个
老博后合写的，里面有张WT电泳图要显示A在这类淋巴瘤细胞系里，相对与之对应的另
外一类淋巴瘤细胞是高表达的。蛋白A有100kd左右，但是这张WT的图显示的带在35KD左
右，他们解释为是A的特异性降解带。图好像是故意调过的，突出了他们想要表达的意
思。我专门验证过，A的蛋白水平并不是在这类淋巴瘤细胞系的每种细胞表达量都高，
有的非常低，而对应的另一类淋巴瘤也不是都低，也有很高的。所以感觉其立题的依据
就有问题了。关于A的文章很少，都不是什么重要的发现，都是些比较小的文章。去年
年底在两种细胞系上knockdown，测microarray，结果very flat，平均每种细胞就只有
10来个2 fold change的基因，GO term什么的都没法做啦！挑了一个比较有意思B的出
来，做WT，A knockdown后B有时能下调很多，有时就下调一点点。今年又做了RNAseq，
不知道我怎么这么倒霉，RNAseq测的质量很好，但是mapping效率太低，结果也是very
flat，P value都非常高，不可信。感觉折腾了这么久，连个direction都没找到。
老板又老又穷又没法沟通，次次talk都要讲3h的废话，经常记错和混淆东西，
就拿这次RNAseq的结果，测成那样了 ，他老还是信心十足，问我不止一次为什么一些
fold change大的，为么P Value会那么高，他觉得fold change大的，对应的P value应
该低才对。我跟他解释，他也自顾自说，好在data是找别人分析的。跟帮我分析data的
韩国GG聊，他说不光测序很要运气，就是做转录因子也很要运气，他在yeast里做了36
个transcriptional factor，就只有两三个可以测到比较好的RNAseq和chip-seq data.
我下步可能会做chip-seq。但是我现在怕了都，对这种测序的玩意儿。我就不晓得，我
的microarray和RNAseq是我运气不好测的不好，还是本来我这个蛋白A在这类淋巴瘤里
面没什么重要的作用，而测出来的结果都很flat。大家怎么看呢？什么意见？
现在每天都是想逃离的状态，一到lab就想逃，但是ID在这读书，也是因为ID来
这里的，也没法逃。所以每天都在坚持，一边感觉做不下没去没希望浪费时间，一边感
觉自己还没有足够workhard在良心上谴责自己，同时忍受时不时lab快要倒闭关门的风
声，经常要被lab里过期的酶啊，老印大妈给错细胞细菌啊，买东西被老印大叔盘问，
lab发的文章中用的shRNA实际不怎么work啊之类的乱七八糟的事情刺激。不晓得怎么这
么悲催！当初心急，没再等等，多找几个，也被人忽悠说老板人很nice之类的，就带着
一点不情愿来到这个坑里了。真是被坑惨了呀！ |
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l**********e
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n******7
发帖数: 12463 | 12 学学NGS数据分析，练练编程
结果不管了，听天由命 |
C*******4
发帖数: 400 | 13 看你做、写了那么多我觉得你CHIP-SEQ做了会有新东西出来。你要多做几个横向比较的
系统，不要只为一个假设做一个实验。有时候这些看似多余的横向比较会给你新的线索
，很可能帮你找到新的突破口。加油，看好你。 |
f****b
发帖数: 2410 | |
y****n
发帖数: 203 | 15 加油，看好你，描述很简单明了
data
【在 z********o 的大作中提到】
: 博后搞了个新field，虽然比较陌生，但是做着做着觉得做不下去啦！
: 老板很老，以前80年代90年代早期靠钓新基因发家的，整了一堆蛋白放那里
: 。看看别人有什么新发现，就拿出来再做一做。我目前做的这个蛋白，在此叫做A. 在
: 02年,有个牛人在其有五六十页的专利的一个table里面列出来，说这个蛋白在一类淋巴
: 瘤细胞里面表达量高，估计跟这类淋巴瘤关系密切。应该是根据microarray得到的data
: 来推论的。但是之后牛人发了好多paper，关于这类淋巴瘤的，转录因子，蛋白激酶，
: 做了一大堆，也测了很多microarray 和RNAseq的data，但就是在其文章中找不到关于
: 我做的这个蛋白A的只言片语。我的老板写的grant，跟这个牛人实验室独立出来的一个
: 老博后合写的，里面有张WT电泳图要显示A在这类淋巴瘤细胞系里，相对与之对应的另
: 外一类淋巴瘤细胞是高表达的。蛋白A有100kd左右，但是这张WT的图显示的带在35KD左
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