e********r 发帖数: 147 | 1 我们研究一个病原细菌的蛋白酶A,发现它能把一个受体B的信号识别区降解掉。A能够
切割B的生化证据和蛋白互作的证据都是明确的,已经拿到手了。
但遗传分析不知该作如何解释,请大家看一看:
事实一:蛋白酶A突变以后会使细菌致病力下降
事实二:受体B突变以后也会使细菌致病力下降
结果我们在蛋白酶A突变体里过表达受体B,细菌致病力照理说恢复一些是正常的,可这
个菌株的致病力下降得更严重!
做A和B双突的结果还没出来,所以暂时木有更多的提示。
这个我怎么解释,或者用什么样的model,才能把遗传数据和生化数据捏到一起呢? |
g*****n 发帖数: 241 | 2 问两个问题
1:A和B的突变体都是null mutation吗?
2:你说“A能把一个受体B的信号识别区降解掉”,这个降解是激活还是抑制B? |
e********r 发帖数: 147 | 3 A和B的突变体都是删除突变体,所以是null mutation.
A把受体B的信号识别区降解掉,这个结果是完全抑制了B的激酶活性。
不知有何建议?
【在 g*****n 的大作中提到】 : 问两个问题 : 1:A和B的突变体都是null mutation吗? : 2:你说“A能把一个受体B的信号识别区降解掉”,这个降解是激活还是抑制B?
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D*a 发帖数: 6830 | |
l***y 发帖数: 638 | 5 A切B产生致病,可能有活性的是B被A切后的小片段,可以尝试一下在wt或者A突变里表达
一下B的短form
另外这个B的激酶活性和致病力的关系有没有做过?
【在 e********r 的大作中提到】 : A和B的突变体都是删除突变体,所以是null mutation. : A把受体B的信号识别区降解掉,这个结果是完全抑制了B的激酶活性。 : 不知有何建议?
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K**4 发帖数: 1015 | 6 我觉得你首先要回答下面的问题:
1:A是intracellular protease,还是membrane bound version, or secreted? 细菌
中的蛋白酶定位不同,参与的过程和意义是很大却别的。A还有别的domain吗
2:B定位哪里,功能已知吗?
3:A,B 是紧密相关吗?他们两个共同参与一个pathway还是分别不同的?
【在 e********r 的大作中提到】 : 我们研究一个病原细菌的蛋白酶A,发现它能把一个受体B的信号识别区降解掉。A能够 : 切割B的生化证据和蛋白互作的证据都是明确的,已经拿到手了。 : 但遗传分析不知该作如何解释,请大家看一看: : 事实一:蛋白酶A突变以后会使细菌致病力下降 : 事实二:受体B突变以后也会使细菌致病力下降 : 结果我们在蛋白酶A突变体里过表达受体B,细菌致病力照理说恢复一些是正常的,可这 : 个菌株的致病力下降得更严重! : 做A和B双突的结果还没出来,所以暂时木有更多的提示。 : 这个我怎么解释,或者用什么样的model,才能把遗传数据和生化数据捏到一起呢?
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e********r 发帖数: 147 | 7 这个做过了,没有什么影响,所以不太像是过表达本身造成的。
【在 D*a 的大作中提到】 : 不懂,就瞎问问:正常细菌过表达B是什么表型?
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e********r 发帖数: 147 | 8 嗯,您说的对,应该这么做。我们正在找具体的切点,搞清楚后就可以做过表达了。
表达
【在 l***y 的大作中提到】 : A切B产生致病,可能有活性的是B被A切后的小片段,可以尝试一下在wt或者A突变里表达 : 一下B的短form : 另外这个B的激酶活性和致病力的关系有没有做过?
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e********r 发帖数: 147 | 9 谢谢哈,还过这些实验多数都做过了。
1. A是periplasmic protein, 切的位点正好是B位于periplasm的信号感应区。A还有别
的domain,它与B相互作用的domain我们已经搞清楚了。
2. B是受体激酶,所以是跨inner-membrane protein,但有一个region在periplasm中
,被A切。
3. A, B功能不同,但在这个表型上存在密切滴相互作用。
【在 K**4 的大作中提到】 : 我觉得你首先要回答下面的问题: : 1:A是intracellular protease,还是membrane bound version, or secreted? 细菌 : 中的蛋白酶定位不同,参与的过程和意义是很大却别的。A还有别的domain吗 : 2:B定位哪里,功能已知吗? : 3:A,B 是紧密相关吗?他们两个共同参与一个pathway还是分别不同的?
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