q**********0 发帖数: 335 | 1 最近用共转染实验检测一蛋白对某promoter(firefly luciferase reporter
)的激活作用。按照惯例,用Renilla Luciferase (TK promoter)作transfection
efficiency control,但确发现Renilla control老是和firefly成比例的增高或降低,
查文献,没有任何线索表明会TK promoter被我们所调查的蛋白激活,以前用共转染实
验检测另一蛋白也遇到相似的问题,似乎这种体外表达的蛋白对任何一种promoter都有
非特异的激活or抑制,不知版上同仁是否遇到同样问题?用其他什么办法控制
transfection efficiency consistency更好? |
m******5 发帖数: 1383 | 2 我也不大懂这个系统,借地问两句,听说现在有一种说法是这种实验如果作为主体很容
易被打回来,因为不是很科学的系统。 好文章现在这种实验都是藏在一个小pannel里
佐证一下 |
q**********0 发帖数: 335 | 3 我自己的切身体会也感觉到这个系统不科学,首先就不能保证几个plasmids进入同一个
细胞。
【在 m******5 的大作中提到】 : 我也不大懂这个系统,借地问两句,听说现在有一种说法是这种实验如果作为主体很容 : 易被打回来,因为不是很科学的系统。 好文章现在这种实验都是藏在一个小pannel里 : 佐证一下
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b**********8 发帖数: 349 | 4 顶楼主,我做dual luciferase reporter好久了,也碰到跟你一模一样的问题。我感觉
这套系统真的很不stable,因此不是很reliable,那些通过dual luciferase reporter
就能找到一个关键的cis elenmentary sequences的paper,让我看的好生羡慕和佩服啊
,我自己做promoter和3‘UTR的dual luciferase reporter,出来的数据从来都是忽高
忽低的,就算有差异,也只有40%左右,根本做不到人家paper上的那么significantly
。 |
q**********0 发帖数: 335 | 5 说实话,我现在就是在重复一个paper的结果,用的是一模一样的试验系统(除培养基
brand),但就是重复不出来,我的也是忽高忽低,一点也不consistency.真是纳闷的很呢,
请这方面有经验的高人指导一下吧,怎样做出稳定的数据呢?
reporter
significantly
【在 b**********8 的大作中提到】 : 顶楼主,我做dual luciferase reporter好久了,也碰到跟你一模一样的问题。我感觉 : 这套系统真的很不stable,因此不是很reliable,那些通过dual luciferase reporter : 就能找到一个关键的cis elenmentary sequences的paper,让我看的好生羡慕和佩服啊 : ,我自己做promoter和3‘UTR的dual luciferase reporter,出来的数据从来都是忽高 : 忽低的,就算有差异,也只有40%左右,根本做不到人家paper上的那么significantly : 。
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z********i 发帖数: 610 | 6 我们主要是做细胞方面的东西,reporter assay也做的比较多,经常会遇到你说的这种
情况,我个人觉得是transfection的影响,就是用空质粒补平了,也会出现。有这种情
况,在转染试剂一定量得情况下,共转两个质粒,一个质粒单转+空载体补平,你会发
现共转的表达强。
所以需要用其它的质粒去normalize。一般这种实验不是主要data,重复几次结果一致
就可以了。
【在 q**********0 的大作中提到】 : 最近用共转染实验检测一蛋白对某promoter(firefly luciferase reporter : )的激活作用。按照惯例,用Renilla Luciferase (TK promoter)作transfection : efficiency control,但确发现Renilla control老是和firefly成比例的增高或降低, : 查文献,没有任何线索表明会TK promoter被我们所调查的蛋白激活,以前用共转染实 : 验检测另一蛋白也遇到相似的问题,似乎这种体外表达的蛋白对任何一种promoter都有 : 非特异的激活or抑制,不知版上同仁是否遇到同样问题?用其他什么办法控制 : transfection efficiency consistency更好?
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z********i 发帖数: 610 | 7 你可以做IF染色看一下就知道了,基本上都是共转的,虽然其中的原理并不知道,所以
这个问题不用担心。
我们做stable cell lines的时候,载体上并没有抗性基因,就是共转一个抗性基因,
然后用药去筛,挑几个克隆,90%以上的都能表达。
【在 q**********0 的大作中提到】 : 我自己的切身体会也感觉到这个系统不科学,首先就不能保证几个plasmids进入同一个 : 细胞。
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B******o 发帖数: 496 | 8 我觉得你如果对共转染的数据不是很有信心的话,可以先转一个质粒,然后reseed细胞
,再转你要表达的蛋白。读值的时候用蛋白量来normalization。这样也是可以的
【在 q**********0 的大作中提到】 : 最近用共转染实验检测一蛋白对某promoter(firefly luciferase reporter : )的激活作用。按照惯例,用Renilla Luciferase (TK promoter)作transfection : efficiency control,但确发现Renilla control老是和firefly成比例的增高或降低, : 查文献,没有任何线索表明会TK promoter被我们所调查的蛋白激活,以前用共转染实 : 验检测另一蛋白也遇到相似的问题,似乎这种体外表达的蛋白对任何一种promoter都有 : 非特异的激活or抑制,不知版上同仁是否遇到同样问题?用其他什么办法控制 : transfection efficiency consistency更好?
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b**********8 发帖数: 349 | 9
你这个方法也是解决问题的一个办法,不过如果表达的外源蛋白对细胞的增殖有影响的
话,最终导致细胞数不一致,所以提取的总蛋白量也不一致,这样还可以来做
normalization吗?另外你这里说的蛋白量是蛋白浓度吗?还是其他?
【在 B******o 的大作中提到】 : 我觉得你如果对共转染的数据不是很有信心的话,可以先转一个质粒,然后reseed细胞 : ,再转你要表达的蛋白。读值的时候用蛋白量来normalization。这样也是可以的
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B******o 发帖数: 496 | 10 第一次转染的时候用的reporter plasmid,reseed时候所有well里已经转染的细胞数是
一致的。第二次转染的时候再转你的transcription factor,即使它会促进细胞增殖,
我觉得不会对结果有多大影响,毕竟你的TF如果activate luciferase expression,差
别那是相当大(suppose你24 or 48hr收样品).细胞增殖的过程实际是你的vector在细胞
里被稀释过程,按照你的说法control background luciferase是应该降低的,如果在
这种情况下你能看到明显的activation,那一定是真的对吧
normalization可以用蛋白浓度(前提是上一样的量),和用上样的总蛋白量其实是一样的
道理
只是俺的拙见
【在 b**********8 的大作中提到】 : : 你这个方法也是解决问题的一个办法,不过如果表达的外源蛋白对细胞的增殖有影响的 : 话,最终导致细胞数不一致,所以提取的总蛋白量也不一致,这样还可以来做 : normalization吗?另外你这里说的蛋白量是蛋白浓度吗?还是其他?
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q**********0 发帖数: 335 | 11 谢谢回复!我也正想作个IF试试,只是很好奇,为什么所有plasmid倾向进入同一个细
胞。
【在 z********i 的大作中提到】 : 你可以做IF染色看一下就知道了,基本上都是共转的,虽然其中的原理并不知道,所以 : 这个问题不用担心。 : 我们做stable cell lines的时候,载体上并没有抗性基因,就是共转一个抗性基因, : 然后用药去筛,挑几个克隆,90%以上的都能表达。
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q**********0 发帖数: 335 | 12 谢谢回复!如果先将报告基因转染,在reseed细胞时,该plasmid可能会丢失的,又怎
么能观察到目的蛋白对报告基因启动子的影响呢?况且如果不同时转染的话,怎么能保
证两个plasmids进入同一个细胞呢?
【在 B******o 的大作中提到】 : 我觉得你如果对共转染的数据不是很有信心的话,可以先转一个质粒,然后reseed细胞 : ,再转你要表达的蛋白。读值的时候用蛋白量来normalization。这样也是可以的
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r*****d 发帖数: 366 | 13 我也被同样的问题困扰。。
我不用转染TF,只是加药。。结果加了药以后renilla的读数成比例的上升,导致
firefly/renilla的比例还是不变甚至下降。我看到有些CELL paper,就直接做firefly,
不做renilla...
但确发现Renilla control老是和firefly成比例的增高或降低
【在 q**********0 的大作中提到】 : 谢谢回复!如果先将报告基因转染,在reseed细胞时,该plasmid可能会丢失的,又怎 : 么能观察到目的蛋白对报告基因启动子的影响呢?况且如果不同时转染的话,怎么能保 : 证两个plasmids进入同一个细胞呢?
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W***9 发帖数: 4834 | 14 use B=gal as control
【在 q**********0 的大作中提到】 : 最近用共转染实验检测一蛋白对某promoter(firefly luciferase reporter : )的激活作用。按照惯例,用Renilla Luciferase (TK promoter)作transfection : efficiency control,但确发现Renilla control老是和firefly成比例的增高或降低, : 查文献,没有任何线索表明会TK promoter被我们所调查的蛋白激活,以前用共转染实 : 验检测另一蛋白也遇到相似的问题,似乎这种体外表达的蛋白对任何一种promoter都有 : 非特异的激活or抑制,不知版上同仁是否遇到同样问题?用其他什么办法控制 : transfection efficiency consistency更好?
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w*********e 发帖数: 98 | 15 我前段时间刚遇到过同样的问题。换成CMV promoter的renilla 会好很多。个人认为
我们研究的蛋白对TK promoter 有一定的特异激活作用。希望对你有帮助。
【在 q**********0 的大作中提到】 : 最近用共转染实验检测一蛋白对某promoter(firefly luciferase reporter : )的激活作用。按照惯例,用Renilla Luciferase (TK promoter)作transfection : efficiency control,但确发现Renilla control老是和firefly成比例的增高或降低, : 查文献,没有任何线索表明会TK promoter被我们所调查的蛋白激活,以前用共转染实 : 验检测另一蛋白也遇到相似的问题,似乎这种体外表达的蛋白对任何一种promoter都有 : 非特异的激活or抑制,不知版上同仁是否遇到同样问题?用其他什么办法控制 : transfection efficiency consistency更好?
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f********n 发帖数: 6465 | 16 我做过一次,制备了个稳定转染的细胞系(REPORT和目的质粒双转染)。
问题是只能用很短时间,然后数据就误差很大很大了。
是不是双转染不稳定,只能维持很短时间呢? |
y****6 发帖数: 196 | 17 Use CMV-gal as control. |
q**********0 发帖数: 335 | 18 谢谢以上各位的回复。我也正想用CMV-Reilla试试,希望它不受目的蛋白的影响。
我们转染的目的蛋白和报告基因都是瞬时表达体系,不会整合进宿主基因。所以变异可
能还来自实验系统本身。对于稳定转染的细胞系,是否转染的目的蛋白和报告基因已经
丢失掉? |