w*********n
发帖数: 439 | 1 小弟最近在做chip-seq. 做完了ChIP，准备要送去seq了，才发现我超声的size是这样
的：
请问各位大侠这个size，我还能不能送seq？还是最好重做。 |
w*********n
发帖数: 439 | 2
【在 w*********n 的大作中提到】
: 小弟最近在做chip-seq. 做完了ChIP，准备要送去seq了，才发现我超声的size是这样
: 的：
: 请问各位大侠这个size，我还能不能送seq？还是最好重做。
|
h****n
发帖数: 2552 | |
w*********n
发帖数: 439 | 4 huaxin 大侠， 你确定后面的大拖尾不会影响seq？ |
h****n
发帖数: 2552 | 5 只要你做了size selection的就不会
【在 w*********n 的大作中提到】
: huaxin 大侠， 你确定后面的大拖尾不会影响seq？
|
w*********n
发帖数: 439 | 6 多谢多谢，
那我叫我们core的人做个size seletion· |
o**4
发帖数: 35028 | 7 怎么会有这么大的拖尾呢？
sonication不够啊 |
w*********n
发帖数: 439 | 8 应该是做sonicate不够， 刚sonicate完，取５ｕｌ做ｓｉｚｅ检查的时候没发现。
CHIP做完了才发现。
【在 o**4 的大作中提到】
: 怎么会有这么大的拖尾呢？
: sonication不够啊
|
k*****n
发帖数: 323 | |
d****7
发帖数: 109 | 10 Based on the picture of 2% gel, there are two population in your sample,
which indicates insufficient sonication. Do a size selection to have a look
whether you can get enough material.
You might want to re-do the experiment and do a time series of sonication to
check.
【在 w*********n 的大作中提到】
: 小弟最近在做chip-seq. 做完了ChIP，准备要送去seq了，才发现我超声的size是这样
: 的：
: 请问各位大侠这个size，我还能不能送seq？还是最好重做。
|
|
|
w*********n
发帖数: 439 | 11 小弟最近在做chip-seq. 做完了ChIP，准备要送去seq了，才发现我超声的size是这样
的：
请问各位大侠这个size，我还能不能送seq？还是最好重做。 |
w*********n
发帖数: 439 | 12
【在 w*********n 的大作中提到】
: 小弟最近在做chip-seq. 做完了ChIP，准备要送去seq了，才发现我超声的size是这样
: 的：
: 请问各位大侠这个size，我还能不能送seq？还是最好重做。
|
h****n
发帖数: 2552 | |
w*********n
发帖数: 439 | 14 huaxin 大侠， 你确定后面的大拖尾不会影响seq？ |
h****n
发帖数: 2552 | 15 只要你做了size selection的就不会
【在 w*********n 的大作中提到】
: huaxin 大侠， 你确定后面的大拖尾不会影响seq？
|
w*********n
发帖数: 439 | 16 多谢多谢，
那我叫我们core的人做个size seletion· |
o**4
发帖数: 35028 | 17 怎么会有这么大的拖尾呢？
sonication不够啊 |
w*********n
发帖数: 439 | 18 应该是做sonicate不够， 刚sonicate完，取５ｕｌ做ｓｉｚｅ检查的时候没发现。
CHIP做完了才发现。
【在 o**4 的大作中提到】
: 怎么会有这么大的拖尾呢？
: sonication不够啊
|
k*****n
发帖数: 323 | |
d****7
发帖数: 109 | 20 Based on the picture of 2% gel, there are two population in your sample,
which indicates insufficient sonication. Do a size selection to have a look
whether you can get enough material.
You might want to re-do the experiment and do a time series of sonication to
check.
【在 w*********n 的大作中提到】
: 小弟最近在做chip-seq. 做完了ChIP，准备要送去seq了，才发现我超声的size是这样
: 的：
: 请问各位大侠这个size，我还能不能送seq？还是最好重做。
|
|
|
s**u
发帖数: 45 | 21 感觉没sonication开，用RNase处理一下，看下面的带是不是RNA。 |
d******u
发帖数: 99 | |
B*******u
发帖数: 3789 | |
w*********n
发帖数: 439 | 24 多谢各位指教，已经重新超了
【在 B*******u 的大作中提到】
: 超的不够，
|
